Akira Toudou adalah seorang anak SMA yang menjalani hari-hari yang tenang bersama ibu dan kakak perempuannya, Haruka, di Okinawa utara. Namun, di balik kedamaian tersebut, keluarga mereka menyimpan sebuah rahasia turun-temurun. Haruka mewarisi kekuatan misterius dari ayah mereka yang dikenal sebagai Engine, sebuah kemampuan yang harus ia sembunyikan dari orang lain sepanjang hidupnya. Sementara itu, Akira tidak mewarisi kekuatan apa pun dan sering kali merasa rendah diri akibat kelemahannya.
Suatu hari, berbagai kejadian aneh mulai terjadi di seluruh dunia, menandakan datangnya ancaman baru. Musuh tak dikenal perlahan mendekati Akira dan orang-orang di sekitarnya, memicu konflik besar yang melibatkan masa depan seluruh alam semesta.
Di tengah situasi yang genting ini, seorang adik yang merasa tidak memiliki apa-apa dan seorang kakak yang memikul kekuatan besar harus saling bekerja sama. Keduanya dituntut untuk menemukan potensi sejati yang dapat mereka capai bersama demi menghadapi ancaman yang mengincar keselamatan dunia.
